79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0228 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  36.64 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  37.61 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  38.93 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  36.7 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  36.7 
 
 		 160 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  37.61 
 
 		 145 aa  87.8  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  39.2 
 
 		 161 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  38.74 
 
 		 161 aa  84.3  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  36.7 
 
 		 161 aa  84  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  37.61 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  40.43 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  36.89 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  34.51 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  39.81 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  35.85 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  36.07 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  34.38 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  39.22 
 
 		 136 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  33.9 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  30.08 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  34.78 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  36.97 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  31.2 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  36.14 
 
 		 507 aa  55.1  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  34.74 
 
 		 460 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  39.51 
 
 		 574 aa  51.2  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  35.29 
 
 		 461 aa  50.8  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  32.98 
 
 		 460 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  31.17 
 
 		 516 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  38.46 
 
 		 478 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  32.67 
 
 		 386 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  34.62 
 
 		 474 aa  48.9  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  30.16 
 
 		 512 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  32.97 
 
 		 460 aa  47.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  29.85 
 
 		 491 aa  47.8  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  26.47 
 
 		 525 aa  47.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  33.33 
 
 		 483 aa  47.4  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  34.78 
 
 		 497 aa  47.4  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  30.1 
 
 		 493 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  34.92 
 
 		 524 aa  47.8  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  25.37 
 
 		 499 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  25.37 
 
 		 499 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  36.62 
 
 		 492 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  32.53 
 
 		 633 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  30.34 
 
 		 466 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 491 aa  45.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  28.38 
 
 		 496 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  29.85 
 
 		 461 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  35.62 
 
 		 620 aa  44.7  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  29.85 
 
 		 461 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  28 
 
 		 461 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  28.12 
 
 		 446 aa  44.3  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4193  type II and III secretion system protein  28.4 
 
 		 545 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 479 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  28.43 
 
 		 486 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 690 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  30.68 
 
 		 497 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3797  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  31.03 
 
 		 486 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  31.71 
 
 		 690 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  31.75 
 
 		 480 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  28.09 
 
 		 480 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  28.05 
 
 		 479 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  31.71 
 
 		 679 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  38.33 
 
 		 514 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  32.26 
 
 		 463 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  31.71 
 
 		 690 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  29.49 
 
 		 517 aa  41.6  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  34.07 
 
 		 493 aa  41.6  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  30.49 
 
 		 656 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  33.85 
 
 		 663 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  29.27 
 
 		 652 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  30.49 
 
 		 657 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  30.88 
 
 		 634 aa  40.8  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  33.33 
 
 		 482 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  33.33 
 
 		 482 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  33.33 
 
 		 482 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  25.71 
 
 		 489 aa  40.8  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>