29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0395 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  324  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  87.42 
 
 		 163 aa  288  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  72.99 
 
 		 165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  68.67 
 
 		 161 aa  210  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  73.81 
 
 		 164 aa  203  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  71.3 
 
 		 145 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  52.34 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  44.22 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  53.39 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  51.33 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  48.74 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  49.11 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  38.74 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  35.88 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  38.98 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  37.72 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  36.45 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  30.83 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  31.82 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  30.7 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  31.58 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  30.91 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  35.42 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3797  hypothetical protein  33.66 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  31.75 
 
 		 478 aa  48.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  36.47 
 
 		 483 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  43.86 
 
 		 574 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  54.17 
 
 		 270 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>