55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0415 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  39.01 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  37.4 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  37.24 
 
 		 161 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  37.29 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  41.28 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  36.3 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  35.88 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  36.07 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  33.86 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  39.36 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  33.81 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  40.2 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  35.29 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  35.65 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  34.62 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  34.68 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  38.46 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  38.79 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  38.52 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  34.23 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  32.52 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  38.89 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3797  hypothetical protein  33.61 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  32.41 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  28.97 
 
 		 525 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  30.83 
 
 		 480 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  30.83 
 
 		 479 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  36.49 
 
 		 460 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  32.88 
 
 		 512 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  31 
 
 		 499 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  31.82 
 
 		 497 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  30.95 
 
 		 524 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  27.38 
 
 		 489 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  31 
 
 		 499 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  35.09 
 
 		 486 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  30.26 
 
 		 480 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  35.53 
 
 		 517 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  29.41 
 
 		 516 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  30.26 
 
 		 493 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  34.33 
 
 		 603 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  37.31 
 
 		 482 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  37.31 
 
 		 482 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  37.31 
 
 		 482 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  37.31 
 
 		 482 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  37.31 
 
 		 482 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  30.26 
 
 		 486 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  30.23 
 
 		 492 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  37.31 
 
 		 482 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  36.62 
 
 		 460 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  39.34 
 
 		 574 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  35.21 
 
 		 460 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  30 
 
 		 491 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  36.49 
 
 		 492 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  31.58 
 
 		 493 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>