119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4941 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_4941  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  524  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1306  ABC 2 transport system integral membrane protein  44.53 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5732  polysialic acid transport protein KpsM  38.19 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02828  Polysialic acid transport protein kpsM  36.22 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02777  hypothetical protein  36.22 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000408892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3235  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsM  35.71 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586026  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0624  kpsM protein  35.04 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001784  capsular polysaccharide ABC transporter permease protein KpsM  30.59 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4994  ABC-2 type transporter  34.21 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0111539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3902  ABC-2 type transporter  35.14 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3240  ABC-2 type transporter  36.47 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5003  ABC-2 type transporter  33.72 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  decreased coverage  0.000172705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5955  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03059  KpsM protein  31.82 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1506  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 262 aa  96.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2757  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1950  polysialic acid transport protein  25.9 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1621  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1441  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4148  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424002 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1782  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 		 260 aa  85.9  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2608  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0290  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2305  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  27.54 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3299  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  27.54 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1076  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  27.54 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.424503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3252  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  27.54 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3287  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  27.54 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2183  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  27.54 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1654  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3810  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2125  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5039  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2345  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3917  ABC polysaccharide export transporter, inner membrane subunit  27.01 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4086  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0164855  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1523  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0661  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.0551935 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3996  hypothetical protein  24.88 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106596  normal  0.688861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1151  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0721  hypothetical protein  25.97 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2581  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.817053  unclonable  0.0000138463 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1336  ctrC protein  27 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2736  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0747  hypothetical protein  25.45 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0523  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  29.76 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1205  ABC-2 type transporter  26.43 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.964926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2083  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3868  hypothetical protein  25.33 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6193  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3810  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0777  ABC-2 type transporter  24.45 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  27.7 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2575  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 377 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2962  capsule polysaccharide exporter, inner-membrane protein CtrC  24.24 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.619605  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2467  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.750135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2689  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.908796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  28.02 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  23.35 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2182  ABC polysaccharide/polyol phosphate export systems, inner membrane subunit  27.2 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.718271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0746  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0631  polysaccharide ABC transporter  27.07 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.238006  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  23.36 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  26.05 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0293  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3573  putative ABC-2 type transporter  22.31 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.337642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 263 aa  52.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  26.17 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2382  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  24.24 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  25.94 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4015  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  25.81 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1846  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.461285  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  22.31 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  22.4 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  22.99 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  23.45 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0012  ABC transporter, permease protein  25.83 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.591575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  23.98 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  21.9 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  26.27 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14690  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  23.79 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.544705  hitchhiker  0.00000217507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  23.79 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0027  hypothetical protein  27.59 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 		 261 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  22.6 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  22.55 
 
 		 287 aa  45.4  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  25.53 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  24.4 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  31.93 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>