150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5955 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5955  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 260 aa  523  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001784  capsular polysaccharide ABC transporter permease protein KpsM  30.35 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2757  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4994  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0111539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2581  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.817053  unclonable  0.0000138463 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2305  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  29.32 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3299  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  29.32 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1076  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  29.32 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.424503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3252  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  29.32 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3287  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  29.32 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2183  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  29.32 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5003  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  decreased coverage  0.000172705 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5039  ABC-2 type transporter  32.29 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2125  ABC-2 type transporter  32.29 
 
 		 250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0624  kpsM protein  33.85 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2345  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02828  Polysialic acid transport protein kpsM  29.25 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02777  hypothetical protein  29.25 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000408892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3235  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsM  30.04 
 
 		 258 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586026  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4148  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424002 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3917  ABC polysaccharide export transporter, inner membrane subunit  32.13 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4086  ABC-2 type transporter  32.13 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0164855  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3810  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 248 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2083  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0290  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.8 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1523  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1151  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4941  hypothetical protein  28.34 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0721  hypothetical protein  30 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2962  capsule polysaccharide exporter, inner-membrane protein CtrC  29.76 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.619605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2575  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 377 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3868  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5732  polysialic acid transport protein KpsM  28.8 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0777  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1950  polysialic acid transport protein  30 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1336  ctrC protein  30.89 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0746  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 266 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3996  hypothetical protein  29.41 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106596  normal  0.688861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0747  hypothetical protein  29.61 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1506  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1621  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.12 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1441  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.12 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1782  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  28.35 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0661  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.0551935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2689  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 		 264 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.908796 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0523  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  27.27 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1306  ABC 2 transport system integral membrane protein  28.51 
 
 		 259 aa  85.5  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6193  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 264 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1205  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.964926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0293  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2467  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.750135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1654  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3810  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2736  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03059  KpsM protein  27.23 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2608  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4015  ABC-2 type transporter  24.41 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3848  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.800854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2382  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3902  ABC-2 type transporter  30.64 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2301  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.153846  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3240  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 198 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3573  putative ABC-2 type transporter  22.95 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.337642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  24.23 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  23.19 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  27.6 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  27.6 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  27.6 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  27.6 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  27.6 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  27.6 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  27.6 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.17 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0214  ABC transporter, permease protein  23.72 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.848634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  25.46 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  27.08 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  17.81 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  23.38 
 
 		 294 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  23.08 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  22.02 
 
 		 570 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.72 
 
 		 254 aa  52.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  20.83 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  23.94 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  22.75 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  20.29 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  22.57 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  23.19 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2410  ABC-2 type transporter  18.58 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>