203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02777 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02828  Polysialic acid transport protein kpsM  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02777  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000408892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3235  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsM  97.29 
 
 		 258 aa  490  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586026  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0624  kpsM protein  40.31 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4941  hypothetical protein  36.22 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5732  polysialic acid transport protein KpsM  35.59 
 
 		 302 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03059  KpsM protein  36.89 
 
 		 259 aa  151  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001784  capsular polysaccharide ABC transporter permease protein KpsM  34.39 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1306  ABC 2 transport system integral membrane protein  32.66 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5003  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  decreased coverage  0.000172705 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1782  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  34.24 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1621  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1441  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4994  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0111539 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0290  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  35.18 
 
 		 258 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3902  ABC-2 type transporter  33.82 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3240  ABC-2 type transporter  37.95 
 
 		 198 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4148  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 281 aa  118  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5955  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3917  ABC polysaccharide export transporter, inner membrane subunit  28.92 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4086  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0164855  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2608  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3996  hypothetical protein  29.36 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106596  normal  0.688861 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5039  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2125  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1654  ABC-2 type transporter  30.68 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2581  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.817053  unclonable  0.0000138463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2757  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1336  ctrC protein  27.78 
 
 		 264 aa  95.9  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3810  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0721  hypothetical protein  25 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1506  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1151  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2083  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 271 aa  89  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2305  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  26.42 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3299  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  26.42 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1076  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  26.42 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.424503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3252  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  26.42 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3287  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  26.42 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2183  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  26.42 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1523  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 		 271 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1950  polysialic acid transport protein  27.69 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2962  capsule polysaccharide exporter, inner-membrane protein CtrC  28.97 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.619605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2575  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1205  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.964926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0777  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2689  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.908796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2467  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.750135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3810  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2736  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0631  polysaccharide ABC transporter  26.15 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.238006  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6193  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0747  hypothetical protein  22.08 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2382  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4015  ABC-2 type transporter  27.99 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  24.8 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  22.18 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2038  polysaccharide ABC transporter  24.62 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0661  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.0551935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1284  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3015  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  25.36 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0998219  hitchhiker  0.0000148494 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  19.35 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2345  ABC-2 type transporter  22.44 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0523  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  24.61 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  26.23 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  22.45 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  22.8 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  22.8 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3868  hypothetical protein  27.78 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  21.1 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  23.87 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  23.17 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  23.77 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  24.23 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  23.41 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  24.76 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  23.39 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  24.89 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2055  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  24.23 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3848  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.800854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  24.3 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3573  putative ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.337642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  23.94 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0293  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  25.82 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  22.98 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2139  ABC transporter permease protein  22.91 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.479828  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  24.28 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0746  ABC-2 type transporter  25.67 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>