232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0716 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  540  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  52.81 
 
 		 285 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  50.19 
 
 		 298 aa  292  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  51.67 
 
 		 276 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  51.1 
 
 		 273 aa  288  9e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  50.92 
 
 		 272 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  51.92 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  54.48 
 
 		 279 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  48.5 
 
 		 276 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 271 aa  269  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  47.76 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  52.09 
 
 		 276 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  49.43 
 
 		 275 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  49.03 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  48.13 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  46.44 
 
 		 277 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  46.07 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  46.07 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  46.07 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  46.07 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  46.07 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  46.07 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  46.07 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  45.52 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  45.02 
 
 		 272 aa  238  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  44.4 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  39.92 
 
 		 271 aa  222  7e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  43.13 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  45.14 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  45.35 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0027  hypothetical protein  45.61 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29480  putative permease of ABC-2 transporter  45.39 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0884  ABC-2 type transporter  39 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  36.9 
 
 		 294 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  34.3 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3946  ABC-2 type transporter  35.74 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  35.98 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  36 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  35.88 
 
 		 264 aa  132  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 267 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 258 aa  128  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  35.62 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  31.7 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  35.62 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 		 280 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 		 570 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  30.68 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  27.56 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  30.23 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  32.16 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 268 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  30.39 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  30.39 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 478 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  30.18 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  28.41 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2182  ABC polysaccharide/polyol phosphate export systems, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 259 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.718271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 		 606 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 633 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  27.92 
 
 		 237 aa  92.4  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 282 aa  92  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 		 278 aa  92  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  27.73 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  25.67 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  28.04 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 		 604 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 287 aa  88.6  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  27.9 
 
 		 276 aa  89  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1403  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 		 300 aa  86.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.961258  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.64 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>