239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3924 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 275 aa  547  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  86.18 
 
 		 275 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  64.49 
 
 		 276 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  59.27 
 
 		 298 aa  353  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  62.41 
 
 		 273 aa  341  7e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  57.25 
 
 		 285 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  60 
 
 		 277 aa  327  9e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  59.34 
 
 		 280 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  59.63 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  59.63 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  59.63 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  59.63 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  59.63 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  59.63 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  59.63 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  57.25 
 
 		 279 aa  320  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  60.65 
 
 		 276 aa  313  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  51.45 
 
 		 276 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  56.23 
 
 		 272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  55.97 
 
 		 271 aa  300  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  48.45 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  49.43 
 
 		 273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  49.22 
 
 		 275 aa  249  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  46.47 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  47.86 
 
 		 282 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  43.98 
 
 		 283 aa  231  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  43.98 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  44.57 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  42.08 
 
 		 271 aa  218  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  45.91 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0027  hypothetical protein  48.13 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0884  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  39.41 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29480  putative permease of ABC-2 transporter  41.76 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  34.63 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3946  ABC-2 type transporter  35.79 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  33.59 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 		 267 aa  152  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  32.3 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  34.09 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  31.66 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  35.78 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  32.82 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  35.97 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  35.78 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  32.17 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  31.21 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  32.32 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  31.32 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  32.25 
 
 		 633 aa  118  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  32.9 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 268 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  28.47 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  29.17 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  27.72 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  28.19 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 268 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 		 570 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 606 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 		 604 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  31.01 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 278 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2182  ABC polysaccharide/polyol phosphate export systems, inner membrane subunit  29.23 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.718271  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  28.09 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  30.53 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  29.48 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  32.66 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  29.1 
 
 		 237 aa  99  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  27.61 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 278 aa  96.3  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  25.57 
 
 		 258 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>