232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2756 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  100 
 
 
633 aa  1248    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  49.76 
 
 
604 aa  531  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  49.84 
 
 
606 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  35.27 
 
 
570 aa  365  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  39.78 
 
 
258 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  34.94 
 
 
263 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  41 
 
 
278 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  35.02 
 
 
257 aa  154  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  34.02 
 
 
316 aa  152  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  36.76 
 
 
283 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 
265 aa  142  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 
478 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  32.6 
 
 
282 aa  140  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  35.66 
 
 
283 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  34.76 
 
 
278 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 
261 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  38.43 
 
 
283 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  29.72 
 
 
276 aa  133  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 
278 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  33.1 
 
 
310 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  35.04 
 
 
265 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 
268 aa  130  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 
268 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  31.62 
 
 
253 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  30.77 
 
 
276 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  32.33 
 
 
264 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  34.51 
 
 
265 aa  127  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 
277 aa  127  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  32.12 
 
 
273 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  32.12 
 
 
273 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  34.69 
 
 
318 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  31.83 
 
 
276 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  30.55 
 
 
283 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 
264 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 
281 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 
301 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 
290 aa  125  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  32.96 
 
 
282 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  34.19 
 
 
265 aa  124  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 
278 aa  124  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  32.22 
 
 
298 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 
263 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 
295 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 
283 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  31.91 
 
 
276 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 
282 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 
279 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 
283 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 
284 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 
275 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  30.47 
 
 
298 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 
284 aa  118  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  31.07 
 
 
273 aa  117  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 
277 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  27.61 
 
 
276 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  31.99 
 
 
285 aa  117  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 
276 aa  117  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  29.47 
 
 
275 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 
294 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 
275 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 
285 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  29.71 
 
 
264 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  31.73 
 
 
277 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 
278 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 
294 aa  114  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 
289 aa  114  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  35.38 
 
 
266 aa  113  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 
279 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  30.51 
 
 
272 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  32.9 
 
 
257 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 
274 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  31.15 
 
 
259 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 
274 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  33.21 
 
 
272 aa  112  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0431  ABC-2 type transporter  32.1 
 
 
275 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 
279 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
277 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  30.85 
 
 
279 aa  110  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 
281 aa  109  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  29.93 
 
 
276 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  28.52 
 
 
271 aa  109  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  29.89 
 
 
283 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 
282 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  32.17 
 
 
277 aa  107  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 
328 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 
294 aa  107  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 
261 aa  107  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 
280 aa  107  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  30.11 
 
 
287 aa  107  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 
273 aa  107  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 
269 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.68 
 
 
296 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 
279 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  29.56 
 
 
282 aa  104  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  31.18 
 
 
273 aa  104  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 
287 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 
267 aa  103  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  29.7 
 
 
269 aa  103  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  29.47 
 
 
282 aa  102  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  29.89 
 
 
268 aa  102  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>