217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0519 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 275 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0431  ABC-2 type transporter  92.73 
 
 		 275 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  50.18 
 
 		 294 aa  264  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  49.64 
 
 		 276 aa  263  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  43.97 
 
 		 278 aa  222  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  37 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 633 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08880  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.03 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.37019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 604 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 606 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2573  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 570 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2422  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0816937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  32.13 
 
 		 293 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  29.02 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  30.18 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  33.58 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  28.2 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  30.68 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  30.68 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3886  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.35 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  29.8 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  31.99 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  26.14 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  27.31 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  26.2 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 316 aa  96.3  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 310 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  28.03 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  24.91 
 
 		 313 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  23.42 
 
 		 301 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  32.2 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 		 272 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 281 aa  92  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 478 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26770  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.38 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.99915 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 273 aa  88.6  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.36 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  27.97 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  23.95 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  25.55 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  25.55 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0637  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  24.77 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  29.69 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  26.78 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  24.64 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 278 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  29.76 
 
 		 268 aa  85.5  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 278 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  26.58 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  28.89 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  21.98 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>