205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2573 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2573  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 293 aa  574  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2422  ABC-2 type transporter  57 
 
 		 293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0816937 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08880  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  58.9 
 
 		 287 aa  309  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.37019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3886  ABC-2 type transporter  58.62 
 
 		 296 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  55.67 
 
 		 293 aa  301  8.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  52.07 
 
 		 306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1403  ABC-2 type transporter  42.11 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.961258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0637  ABC-2 type transporter  46.5 
 
 		 287 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  38.55 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  32.79 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  32.3 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  29.56 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 278 aa  118  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  31.73 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  28.52 
 
 		 259 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  26.43 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 570 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0431  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 253 aa  99.8  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 263 aa  99.4  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 		 281 aa  99  8e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 478 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  29.26 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  29.45 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 278 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 278 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 281 aa  95.9  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  29.54 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  31.38 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  31.48 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 		 283 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26770  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.18 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.99915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  33.17 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  25.09 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  29.21 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  27.07 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  27.99 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 275 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 633 aa  89.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  30.57 
 
 		 272 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  24.13 
 
 		 269 aa  89  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  27.78 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  29.36 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  29.74 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  28.05 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  25.74 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  31.42 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 279 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  28.83 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  27.65 
 
 		 237 aa  85.9  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  30.23 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  26.23 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.14 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  28.62 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 604 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  29.45 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  29.45 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  27.04 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.45 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.45 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  29.45 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  29.45 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.45 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  28.38 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  31.48 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  26.26 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  29.09 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  31.09 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  29.3 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>