241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4205 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 268 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  36.56 
 
 		 570 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  32.96 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  33.98 
 
 		 264 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 258 aa  139  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  34.14 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 		 257 aa  132  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  38.82 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 633 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  34.06 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  31.73 
 
 		 282 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  28.16 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 478 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  31.02 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 		 606 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  32.21 
 
 		 604 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  31.9 
 
 		 279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  28.98 
 
 		 276 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 253 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  31.58 
 
 		 264 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  30.65 
 
 		 265 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  34.02 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  29.41 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  30.8 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  27.01 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  34.26 
 
 		 278 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  33.45 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 		 292 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 278 aa  106  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  25.57 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  25.57 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  30.31 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  31.18 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  28.1 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  33.91 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  33.52 
 
 		 237 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  31.41 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  28.99 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 		 295 aa  99.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  28.78 
 
 		 271 aa  99.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 298 aa  99  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0610  hypothetical protein  27.82 
 
 		 258 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 290 aa  98.6  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  30.11 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  28.27 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  28.47 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  28.18 
 
 		 276 aa  95.5  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 266 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 288 aa  95.5  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 284 aa  95.5  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 328 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2573  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  30.14 
 
 		 272 aa  92.4  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  26.45 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  28.68 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  27.38 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  27 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  27.34 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  27.34 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  25.71 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>