242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4466 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 478 aa  963    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  44.7 
 
 		 263 aa  223  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  36.1 
 
 		 284 aa  176  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  40.47 
 
 		 258 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  38.15 
 
 		 570 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  40.4 
 
 		 266 aa  162  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  35.11 
 
 		 606 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  35.49 
 
 		 604 aa  154  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  33.05 
 
 		 283 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  32.51 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 265 aa  140  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  35.1 
 
 		 257 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 		 253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  37.44 
 
 		 278 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 		 633 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 		 282 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  34.13 
 
 		 272 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 268 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 261 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  33.47 
 
 		 283 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 		 282 aa  127  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 278 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  33.89 
 
 		 283 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 273 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 276 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 273 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 289 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  36.23 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  33.05 
 
 		 282 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 274 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  34.38 
 
 		 283 aa  123  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 268 aa  123  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  31.7 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  35.46 
 
 		 278 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 279 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 298 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 268 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 277 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 278 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.51 
 
 		 306 aa  120  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 295 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  35.45 
 
 		 285 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 269 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  33.49 
 
 		 278 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  33.49 
 
 		 278 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 288 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  32.45 
 
 		 290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 282 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  30.43 
 
 		 287 aa  114  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  30.13 
 
 		 294 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  27.55 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  32.63 
 
 		 237 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  33.46 
 
 		 268 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 		 281 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  35.08 
 
 		 282 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 270 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  29.12 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  29.32 
 
 		 276 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  27.16 
 
 		 264 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  34.23 
 
 		 268 aa  107  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 279 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  34.1 
 
 		 276 aa  107  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  34.95 
 
 		 279 aa  107  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 279 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  29.23 
 
 		 277 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  28.63 
 
 		 264 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 277 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  29.23 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  29.23 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 276 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 283 aa  103  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 273 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  28.1 
 
 		 259 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  27.99 
 
 		 271 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  29.37 
 
 		 298 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 264 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 294 aa  101  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1284  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 		 265 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 		 292 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  29.72 
 
 		 275 aa  100  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  28.23 
 
 		 273 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  27.2 
 
 		 276 aa  100  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  33.49 
 
 		 277 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  27.27 
 
 		 275 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 274 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  26.1 
 
 		 276 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 261 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  28.4 
 
 		 265 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  28.97 
 
 		 257 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  33.91 
 
 		 268 aa  98.6  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 285 aa  99  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 284 aa  97.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  30.05 
 
 		 265 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 316 aa  97.4  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>