237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3132 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 570 aa  1154    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  39.1 
 
 		 604 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  38.37 
 
 		 606 aa  363  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  35.43 
 
 		 633 aa  345  8.999999999999999e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  37.08 
 
 		 258 aa  189  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  38.15 
 
 		 478 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  36.43 
 
 		 257 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  35.14 
 
 		 265 aa  149  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  33.59 
 
 		 283 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  36.56 
 
 		 277 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 		 278 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  34.96 
 
 		 310 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 		 253 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  33.09 
 
 		 282 aa  144  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  34.38 
 
 		 283 aa  144  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  35.56 
 
 		 261 aa  144  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 		 278 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 298 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 278 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  32.06 
 
 		 263 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  35.45 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  35.62 
 
 		 283 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 282 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  35.85 
 
 		 287 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  36.74 
 
 		 294 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  35.84 
 
 		 295 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  29.48 
 
 		 259 aa  130  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  32.57 
 
 		 276 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  34.94 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 		 268 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  32.48 
 
 		 283 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  32.45 
 
 		 279 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  32.83 
 
 		 277 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 284 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  32.07 
 
 		 264 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  34.11 
 
 		 276 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  28.57 
 
 		 276 aa  127  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  34.68 
 
 		 281 aa  127  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  34.74 
 
 		 279 aa  126  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 282 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 		 283 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  29.46 
 
 		 276 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  32.39 
 
 		 264 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  31.06 
 
 		 283 aa  125  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 		 290 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  34.04 
 
 		 265 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.28 
 
 		 296 aa  124  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  35.45 
 
 		 289 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 279 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  33.92 
 
 		 273 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  33.92 
 
 		 273 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  33.05 
 
 		 265 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  33.49 
 
 		 275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 		 278 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  33.93 
 
 		 274 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 		 278 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 277 aa  117  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 294 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  30.7 
 
 		 257 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 		 269 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 280 aa  114  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  27.23 
 
 		 313 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  33.19 
 
 		 264 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  33.94 
 
 		 273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  28.64 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 301 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  29.21 
 
 		 283 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  29.21 
 
 		 283 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 		 268 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 281 aa  111  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 285 aa  112  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 285 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 		 270 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  31.36 
 
 		 265 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  25.8 
 
 		 294 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  30.15 
 
 		 275 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  32.54 
 
 		 268 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 261 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  34.63 
 
 		 278 aa  110  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  30.97 
 
 		 288 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  27.92 
 
 		 276 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 263 aa  109  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  30.13 
 
 		 271 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 274 aa  109  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  26.28 
 
 		 283 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  28.98 
 
 		 273 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  33.62 
 
 		 282 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 		 275 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 282 aa  107  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 328 aa  106  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  30.68 
 
 		 277 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  30.68 
 
 		 277 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 		 277 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 		 277 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 		 277 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 		 277 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 		 277 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0860  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 324 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  30.08 
 
 		 273 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  28.31 
 
 		 298 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>