255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_71960 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  100 
 
 		 265 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  98.49 
 
 		 265 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  81.51 
 
 		 265 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  64.77 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  63.26 
 
 		 264 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  65.25 
 
 		 263 aa  350  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  52.33 
 
 		 261 aa  290  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  46.21 
 
 		 264 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  43.56 
 
 		 264 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  45.38 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  40.68 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  35.04 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  37.45 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  37.12 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  38.08 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  36.02 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  33.96 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  36.71 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  32.82 
 
 		 276 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  34.47 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 		 298 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  34.03 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  32.83 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 282 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 284 aa  138  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  34.14 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  31.27 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  32.44 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  33.96 
 
 		 273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0495  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.26 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0237472  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  32.96 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  34.9 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 		 604 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  36.25 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  34.04 
 
 		 606 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  33.05 
 
 		 570 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  36.73 
 
 		 277 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  32.21 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  37.56 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  37.56 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  37.56 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  37.56 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  37.56 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  37.56 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  37.56 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  34.63 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 288 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  32.21 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  32.74 
 
 		 633 aa  125  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  33.04 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  36.25 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  32.28 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  30.18 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  31.89 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  28.95 
 
 		 287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  33.33 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 		 282 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  32.28 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  26.42 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  26.42 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  31.42 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4146  ABC-2 type transporter  36.73 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  hitchhiker  0.00000138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  31 
 
 		 237 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  29.96 
 
 		 283 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0610  hypothetical protein  29.92 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  26.8 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29480  putative permease of ABC-2 transporter  31.54 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  36.25 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 478 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  33.17 
 
 		 318 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0884  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>