240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2171 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 261 aa  520  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  55.17 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  55.17 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  55.94 
 
 		 265 aa  298  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  54.05 
 
 		 263 aa  295  5e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  52.33 
 
 		 265 aa  258  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  52.33 
 
 		 265 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  38.61 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  40.15 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  42.25 
 
 		 263 aa  198  6e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  41.06 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  37.7 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  30.62 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  27.88 
 
 		 276 aa  135  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0495  putative ABC-2 type transport system permease protein  33.87 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0237472  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  29.96 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  32.83 
 
 		 289 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 283 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  29.76 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  30.68 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  30.13 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  28.9 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 298 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 295 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  28.4 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 288 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  27.67 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  32.02 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  30.92 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  28.19 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  29.65 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 570 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  31.38 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  29.71 
 
 		 237 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 281 aa  108  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  30.19 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  29.81 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  29.81 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.81 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.81 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  29.81 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  29.81 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.81 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  25.78 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  25.78 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 		 606 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 604 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0610  hypothetical protein  27.67 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  29.2 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  26.59 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  29.46 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 478 aa  99.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 294 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  27.41 
 
 		 283 aa  99  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 316 aa  98.6  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  29.69 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 283 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 633 aa  96.3  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  29.52 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 		 278 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>