244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0650 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 		 257 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  56.08 
 
 		 282 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  53.73 
 
 		 272 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  52.73 
 
 		 276 aa  289  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  53.91 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  49.81 
 
 		 280 aa  275  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  48.26 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  49.62 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  49.62 
 
 		 279 aa  270  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  48.45 
 
 		 275 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  50.19 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  49.03 
 
 		 273 aa  259  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  47.29 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  47.29 
 
 		 275 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  47.91 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  48.65 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  48.29 
 
 		 283 aa  245  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  43.41 
 
 		 277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  42.53 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  42.53 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  41.63 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  47.24 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  45.42 
 
 		 273 aa  214  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  44.71 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0884  ABC-2 type transporter  39.61 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  40.93 
 
 		 280 aa  175  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29480  putative permease of ABC-2 transporter  39.68 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  35 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  36.22 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0027  hypothetical protein  40.34 
 
 		 239 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3946  ABC-2 type transporter  36.15 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  32.17 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  31.62 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  31.1 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  33.59 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  33.59 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  31.8 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  30.8 
 
 		 265 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  28.74 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  30.8 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  30.7 
 
 		 570 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  26.95 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  27.84 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  32.9 
 
 		 633 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 		 606 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 		 604 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  25.1 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  30.55 
 
 		 301 aa  99.4  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 478 aa  99  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 279 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  26.17 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  29.17 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  25.19 
 
 		 288 aa  95.9  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  26.87 
 
 		 276 aa  95.9  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 279 aa  95.1  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2182  ABC polysaccharide/polyol phosphate export systems, inner membrane subunit  29.18 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.718271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  28.63 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  25.59 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 282 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  31.67 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 282 aa  92.4  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 274 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  28.94 
 
 		 268 aa  92.4  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  31.5 
 
 		 318 aa  92  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 277 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  28.24 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 283 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  28.02 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>