233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3461 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  100 
 
 		 271 aa  535  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  44.83 
 
 		 272 aa  255  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  42.96 
 
 		 279 aa  241  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  39.92 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  42.21 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  42.08 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  41.89 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  43.8 
 
 		 272 aa  230  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  42.54 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  41.63 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  40.7 
 
 		 276 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  39.92 
 
 		 273 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  41.8 
 
 		 282 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  42.7 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  39.49 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  38.06 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  38.06 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  37.17 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  42.08 
 
 		 275 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  39.39 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  39.62 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  36.68 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  36.68 
 
 		 283 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  37.96 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29480  putative permease of ABC-2 transporter  37.74 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0884  ABC-2 type transporter  37.79 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0027  hypothetical protein  37.66 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  34.86 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  31.66 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  33.19 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3946  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  27.24 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  31.44 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  34.08 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  27.55 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  29.73 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  28.51 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  27.93 
 
 		 264 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  27.06 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  29.65 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  28.96 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  26.95 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  30.28 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 570 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 268 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  29.54 
 
 		 606 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  29.88 
 
 		 237 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 604 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  27.99 
 
 		 478 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  26.37 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 633 aa  99.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  22.59 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.85 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  28.31 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  26.39 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  26.39 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  26.39 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  24.25 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 274 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2410  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 282 aa  92.4  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  27.68 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>