283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1724 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  100 
 
 
274 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  72.99 
 
 
278 aa  422  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  70.7 
 
 
279 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  73.06 
 
 
277 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  72.79 
 
 
273 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  72.79 
 
 
273 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  68.36 
 
 
275 aa  357  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  64.1 
 
 
283 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  65.56 
 
 
276 aa  356  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  61.68 
 
 
278 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  56.78 
 
 
279 aa  316  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  59.19 
 
 
335 aa  279  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  50.37 
 
 
275 aa  278  6e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  49.61 
 
 
282 aa  272  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  48.83 
 
 
282 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  50 
 
 
277 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  44.44 
 
 
279 aa  256  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  51.16 
 
 
282 aa  244  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  46.67 
 
 
278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  44.79 
 
 
294 aa  242  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  45.49 
 
 
277 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  45.95 
 
 
281 aa  235  7e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  45.31 
 
 
295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  42.97 
 
 
298 aa  228  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  43.35 
 
 
279 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  41.8 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  39.77 
 
 
328 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  35.88 
 
 
289 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  39 
 
 
278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  35.82 
 
 
276 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 
290 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  32.06 
 
 
283 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  31.18 
 
 
287 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  33.83 
 
 
287 aa  149  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 
276 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 
288 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  31.92 
 
 
283 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  31.92 
 
 
283 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  31.91 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 
478 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 
287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  30.12 
 
 
253 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  32.74 
 
 
278 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  32.13 
 
 
606 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 
570 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  31.77 
 
 
604 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 
283 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0327  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 
288 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  30.54 
 
 
237 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 
263 aa  115  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  31.97 
 
 
268 aa  112  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  28.99 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
633 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 
258 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 
257 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 
268 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 
283 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 
285 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 
258 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 
261 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
276 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
278 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  26.82 
 
 
264 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 
283 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 
263 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 
270 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 
284 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  27.31 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  25 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  34.67 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  30 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  26.02 
 
 
273 aa  96.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  26.64 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 
275 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  27.24 
 
 
276 aa  96.3  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 
253 aa  95.5  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  32.06 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  25.58 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  26.55 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  27.44 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  24.23 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 
294 aa  92.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 
273 aa  92.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  25.67 
 
 
281 aa  92  8e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  24.62 
 
 
276 aa  92  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  26.39 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  28.63 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.79 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  24.32 
 
 
265 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1313  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 
266 aa  89.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368172  normal  0.0367769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>