234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4589 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 280 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  34.33 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  35.16 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  35.19 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  31.97 
 
 		 285 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  32.31 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  29.6 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  29.85 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  31.95 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  35.42 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  32.32 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  34.08 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  34.08 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  32.76 
 
 		 275 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  30.3 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  33.92 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  33.09 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  30.62 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  32.34 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  31.06 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0884  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  31.95 
 
 		 275 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  30 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 282 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29480  putative permease of ABC-2 transporter  32.57 
 
 		 267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  31.42 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  31.15 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  29.06 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  29.06 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  34.23 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  28.52 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  28.76 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  27.83 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  25.19 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 606 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 		 604 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 570 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  25 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  32.31 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  30.83 
 
 		 283 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  28.33 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  24.1 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  28.03 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2550  efflux ABC-transporter, permease protein, putative  30.64 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  23.74 
 
 		 259 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  25.19 
 
 		 264 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  29.48 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  25.94 
 
 		 276 aa  92.4  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 478 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  29.57 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.92 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  34.39 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 286 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2182  ABC polysaccharide/polyol phosphate export systems, inner membrane subunit  27.69 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.718271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  24.15 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 316 aa  89  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1313  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 266 aa  89  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368172  normal  0.0367769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.86 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  26.57 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  22.47 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>