252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0506 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  100 
 
 
258 aa  506  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  45.7 
 
 
257 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  37.08 
 
 
570 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  39.78 
 
 
633 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  35 
 
 
264 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 
253 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  41.03 
 
 
604 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  40.16 
 
 
283 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  40 
 
 
606 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  36.29 
 
 
268 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 
261 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  34.1 
 
 
263 aa  158  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  37.99 
 
 
265 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  40.08 
 
 
283 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  35.91 
 
 
265 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  34.5 
 
 
263 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  34.26 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 
278 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  34.21 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  37.99 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  31.84 
 
 
259 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 
310 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  34.35 
 
 
272 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  41.89 
 
 
283 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  34.94 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  34.94 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  31.66 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  34.54 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 
285 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 
283 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  32.51 
 
 
478 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  31.68 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  34.39 
 
 
276 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  32.56 
 
 
278 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 
283 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  31.94 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  36.16 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 
272 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  31.66 
 
 
275 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  31.78 
 
 
273 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  31.42 
 
 
271 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  31.4 
 
 
298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 
282 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  29.64 
 
 
276 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  33.46 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 
277 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 
282 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  32.27 
 
 
257 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  31.66 
 
 
295 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  36.02 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  33.71 
 
 
264 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 
284 aa  131  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  31.68 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  31.37 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  33.21 
 
 
318 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 
294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 
268 aa  129  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  35.24 
 
 
274 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  34.2 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 
273 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 
273 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  28.92 
 
 
276 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  33.33 
 
 
272 aa  125  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  32.78 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0027  hypothetical protein  34.6 
 
 
239 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
272 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 
298 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  34.21 
 
 
268 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  34.78 
 
 
277 aa  123  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  30.12 
 
 
276 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 
268 aa  122  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 
289 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  31.2 
 
 
263 aa  122  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 
284 aa  122  8e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  28.41 
 
 
287 aa  122  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  29.1 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 
278 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 
278 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  29.85 
 
 
278 aa  118  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  28.91 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 
274 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  27.8 
 
 
283 aa  115  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  31.58 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>