228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0602 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 284 aa  577  1.0000000000000001e-163  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  54.15 
 
 		 266 aa  246  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  44.27 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  36.1 
 
 		 478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  34.16 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 		 261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  32.22 
 
 		 604 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  32.21 
 
 		 606 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 258 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  28.85 
 
 		 268 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  31.82 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  28.38 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  30.12 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  35.45 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 570 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 		 633 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  28.19 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  30.13 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  26.16 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  27.56 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  31.46 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  31.64 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  26.09 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 268 aa  96.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.27 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  31.62 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  28.7 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  30.99 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0860  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 324 aa  92.4  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 263 aa  92.4  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  27.6 
 
 		 276 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  28.33 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 276 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  26.27 
 
 		 275 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  28.44 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  26.56 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  30.21 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  31.39 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  27.56 
 
 		 277 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  27.56 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  27.56 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  23.93 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  25.09 
 
 		 276 aa  86.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2310  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  28.67 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2362  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.63 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  26.15 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3946  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  23.74 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08880  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.24 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.37019 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  31.25 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>