179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2362 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2362  ABC-2 type transporter  100 
 
 
305 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2310  ABC-2 type transporter  97.7 
 
 
305 aa  577  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3884  ABC-2 type transporter  58.33 
 
 
283 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3932  ABC-2 type transporter  56.88 
 
 
283 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.182483  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0325  ABC-2 type transporter  54.12 
 
 
285 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.606531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4204  ABC-2 type transporter  44.4 
 
 
279 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2251  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 
301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 
263 aa  99  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  26.61 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 
294 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 
282 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 
478 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
288 aa  89.7  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  25.55 
 
 
287 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 
274 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 
277 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 
279 aa  86.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 
290 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  22.83 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 
570 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  29.03 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  25.53 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  27.73 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 
633 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  27.24 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  26.09 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  26.09 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  23.53 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  25.58 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  22.53 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  26.17 
 
 
253 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  23.55 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  24.42 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  25 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  25.21 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  25.21 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  24.28 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  24.3 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  23.72 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  22.84 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  26.7 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  22.33 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  25 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  24.45 
 
 
606 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  22.35 
 
 
264 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  24.5 
 
 
335 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0431  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  23.89 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  23.74 
 
 
287 aa  63.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  23.15 
 
 
283 aa  63.2  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  26.51 
 
 
265 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  21.34 
 
 
273 aa  62.8  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 
253 aa  62.8  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 
275 aa  62.4  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>