49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2251 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2251  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 301 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3932  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.182483  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2362  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3884  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2310  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4204  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0325  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.606531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3886  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  19.15 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  26.75 
 
 		 287 aa  48.9  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  25 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  27.45 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  26.53 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  23.68 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  23.1 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 276 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  25.46 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  25.49 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  29.69 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  25.93 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  22.79 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  22.4 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2422  ABC-2 type transporter  25.55 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0816937 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 275 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 270 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>