More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1034 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  100 
 
 
282 aa  556  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  50.92 
 
 
282 aa  304  9.000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  54.14 
 
 
278 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  52.16 
 
 
294 aa  298  9e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  51.95 
 
 
277 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  51.56 
 
 
279 aa  288  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  53.52 
 
 
273 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  53.52 
 
 
273 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  52.13 
 
 
281 aa  287  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  50.78 
 
 
278 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  50.78 
 
 
278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  49.06 
 
 
276 aa  270  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  49.07 
 
 
295 aa  269  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  52.94 
 
 
283 aa  267  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  48.94 
 
 
282 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  49.61 
 
 
274 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  44.41 
 
 
298 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  44.57 
 
 
269 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  49.61 
 
 
279 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  44.92 
 
 
275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  50.39 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  46.69 
 
 
275 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  50 
 
 
277 aa  226  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  41.18 
 
 
279 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  39.19 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  42.08 
 
 
279 aa  206  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  43.02 
 
 
277 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  38.32 
 
 
287 aa  192  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  36.26 
 
 
292 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  38.43 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  37.74 
 
 
276 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  34.43 
 
 
287 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  32.23 
 
 
283 aa  169  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 
290 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  34.42 
 
 
287 aa  168  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  38.04 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  32.72 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  33.59 
 
 
283 aa  159  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  33.59 
 
 
283 aa  159  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 
274 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0327  ABC-2 type transporter  32.25 
 
 
288 aa  145  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  33.09 
 
 
570 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  31.66 
 
 
258 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  32.13 
 
 
253 aa  142  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  33.97 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 
263 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  31.49 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 
286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  26.3 
 
 
276 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  32.96 
 
 
277 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  33.07 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 
478 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  33.49 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  30.38 
 
 
264 aa  125  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  30.3 
 
 
263 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  36.18 
 
 
268 aa  125  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 
263 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  32.41 
 
 
265 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  32.55 
 
 
604 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
606 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  32.25 
 
 
310 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  32.41 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 
257 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  30 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  26.64 
 
 
264 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 
278 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 
633 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  25 
 
 
265 aa  106  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 
301 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  27.41 
 
 
264 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  31.23 
 
 
283 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  26.86 
 
 
276 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 
283 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 
258 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 
253 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 
260 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 
283 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 
268 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  28.15 
 
 
275 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  25.64 
 
 
276 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 
273 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  28.16 
 
 
277 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.66 
 
 
306 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 
283 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 
271 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  28.36 
 
 
272 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 
294 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 
270 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 
294 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 
316 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 
285 aa  99  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  30.98 
 
 
272 aa  99  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  27.97 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  28.09 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.693027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>