240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0349 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 328 aa  643    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  42.14 
 
 		 282 aa  233  5e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  42.71 
 
 		 294 aa  228  7e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  46.79 
 
 		 278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  38.93 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  42.08 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  39.61 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  40.78 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  43.08 
 
 		 282 aa  195  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  38.22 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  41.86 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  38.43 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  37.97 
 
 		 278 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  38.22 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  38.22 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  38.61 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  39.38 
 
 		 274 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  36.2 
 
 		 279 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 		 269 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  42.08 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  37.26 
 
 		 279 aa  178  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  43.58 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  35.8 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  35.88 
 
 		 279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  37.07 
 
 		 277 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  33.59 
 
 		 289 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  37.31 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  28.93 
 
 		 287 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  32.75 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  31.12 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  33.85 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  30.47 
 
 		 276 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  33.23 
 
 		 606 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  33.09 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  32.92 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  29.47 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  29.47 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  31.74 
 
 		 604 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  32.1 
 
 		 283 aa  126  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 570 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 		 263 aa  116  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  29.18 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 		 633 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  29.03 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0327  ABC-2 type transporter  30.03 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  31.14 
 
 		 265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  29.63 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 263 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 258 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  31.14 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  29 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  27.69 
 
 		 264 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 261 aa  106  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  36.19 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  30.9 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  28.93 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  34.54 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  32.36 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  30.45 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  35.97 
 
 		 283 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  29.96 
 
 		 276 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 277 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 294 aa  99.8  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  36.87 
 
 		 283 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 		 268 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  30.42 
 
 		 282 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  27 
 
 		 276 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 478 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  29.82 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 257 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  28.9 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  27.27 
 
 		 273 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 		 268 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 271 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  23.33 
 
 		 259 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  32.83 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0431  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 		 275 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  28.96 
 
 		 272 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  26.69 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 273 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 283 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>