236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3693 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 271 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  59.33 
 
 		 272 aa  321  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  59.92 
 
 		 280 aa  313  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  57.2 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  56.99 
 
 		 285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  54.14 
 
 		 298 aa  299  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  53.9 
 
 		 273 aa  292  5e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  55.97 
 
 		 275 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  53.18 
 
 		 276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  54.85 
 
 		 275 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  55.47 
 
 		 276 aa  278  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  53.91 
 
 		 257 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  51.87 
 
 		 277 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  52.04 
 
 		 276 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  50 
 
 		 273 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  51.12 
 
 		 277 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  51.12 
 
 		 277 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  51.12 
 
 		 277 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  51.12 
 
 		 277 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  51.12 
 
 		 277 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  51.12 
 
 		 277 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  51.12 
 
 		 277 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  50 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  49.63 
 
 		 275 aa  259  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  45.86 
 
 		 283 aa  240  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  45.11 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  39.92 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  47.47 
 
 		 282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  47.37 
 
 		 273 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0027  hypothetical protein  47.48 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29480  putative permease of ABC-2 transporter  45.02 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  40.23 
 
 		 294 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  36.23 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0884  ABC-2 type transporter  36.68 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  40.96 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3946  ABC-2 type transporter  38.38 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  37.99 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  32.82 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  36.12 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  34.09 
 
 		 265 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  31.42 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  33.97 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  36.4 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  29.62 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  29.66 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  30.15 
 
 		 264 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 265 aa  118  7.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  31.27 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  30.13 
 
 		 570 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  27.59 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 606 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2182  ABC polysaccharide/polyol phosphate export systems, inner membrane subunit  30 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.718271  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  26.82 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 604 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 268 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  29.15 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  31.34 
 
 		 237 aa  96.3  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 274 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 633 aa  95.5  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  24.25 
 
 		 274 aa  95.5  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  28.63 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  24.22 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  29.01 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 478 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 278 aa  93.2  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  31.49 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 281 aa  91.3  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  26.72 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>