240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1493 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 283 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  97.53 
 
 		 283 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  96.11 
 
 		 283 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  68.15 
 
 		 278 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  33.72 
 
 		 263 aa  176  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  39.22 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  33.58 
 
 		 570 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  36.8 
 
 		 604 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 		 606 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  36.76 
 
 		 633 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  34.39 
 
 		 478 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  36.52 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  33.21 
 
 		 276 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  34.51 
 
 		 282 aa  142  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  32.29 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  30.28 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  38.67 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  34.8 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 		 261 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  36.15 
 
 		 294 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 265 aa  129  6e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  28.69 
 
 		 276 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 		 295 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  32.21 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  32.87 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  31.49 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 		 278 aa  122  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  33.62 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  31.62 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  34.08 
 
 		 285 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  33.97 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  33.97 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 268 aa  119  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  37.56 
 
 		 318 aa  118  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  32.42 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  32.37 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  29.02 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  34.71 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  32.93 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  34.47 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  30.2 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  28.74 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  30.99 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  32.86 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  31.4 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  35.06 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  29.3 
 
 		 272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  26.59 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  37.28 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  34.26 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 272 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  31.5 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  25.18 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  28.81 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  26.97 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  34.55 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  35.18 
 
 		 328 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  29.5 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.04 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  32.89 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  28.82 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  32.03 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0860  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  27.95 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  25.86 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  33.03 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>