More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2464 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 286 aa  568  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  43.21 
 
 		 289 aa  238  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  40.14 
 
 		 288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  43.86 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  41.28 
 
 		 283 aa  220  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  39.58 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  41.64 
 
 		 287 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0327  ABC-2 type transporter  35.76 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  36.82 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  40.8 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  34.8 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  33.22 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  31.73 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 278 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  32.6 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  32.58 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  32.58 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 		 275 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  32.33 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  30.88 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  30.42 
 
 		 274 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 		 277 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  30.63 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  29.01 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  28.35 
 
 		 276 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  27.82 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  26.52 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  29.46 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  29.46 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 604 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 		 606 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  33.58 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  28.82 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 478 aa  99.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  26.62 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  27.88 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  28.82 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  28.68 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 570 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 633 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  36.2 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  27.1 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  26.34 
 
 		 237 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 316 aa  89.7  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 266 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 		 280 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  28.84 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  25.1 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.69 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  26.77 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.1 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1846  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.461285  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  26.28 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  25.67 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  25.09 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  26.01 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>