244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1406 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  36.92 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  37.74 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  35.94 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  38.87 
 
 		 278 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  37.55 
 
 		 279 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 298 aa  168  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  37.64 
 
 		 276 aa  168  9e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  34.06 
 
 		 283 aa  165  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  36.56 
 
 		 277 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 279 aa  165  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 		 278 aa  162  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  36.2 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  37.45 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  35.66 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  34.77 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  35.69 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  33.95 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  35.82 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  34.23 
 
 		 289 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  34.94 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  39.38 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  30.34 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  33.08 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  30.83 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  34.03 
 
 		 604 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  33.76 
 
 		 606 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 570 aa  125  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  29.66 
 
 		 264 aa  125  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 633 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  35.24 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  27.76 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  31.34 
 
 		 283 aa  118  9e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 283 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  28.3 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  28.3 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  33.63 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  29.24 
 
 		 237 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  27.56 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  26.81 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  27.51 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  26.1 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  28.03 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  28.99 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  34.1 
 
 		 478 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  27.82 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  28.29 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  29.66 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  24.89 
 
 		 264 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  29.02 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  27.06 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  26.37 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  26.35 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 276 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  26.17 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  26.97 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  29.43 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 294 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  27.84 
 
 		 272 aa  95.9  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>