218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0450 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 276 aa  557  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  32.25 
 
 		 276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  29.78 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  31.95 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.69 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  28.26 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 279 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  26.3 
 
 		 282 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  25.18 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 		 275 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  28.57 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  27.47 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 328 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  25.86 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 277 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  24.21 
 
 		 283 aa  105  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  25.18 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  24.18 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 292 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  26.29 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  26.22 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  24.7 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0327  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 288 aa  85.5  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  28.21 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  26.32 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2634  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.79755  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  25.55 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  25.55 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  21.27 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  24.41 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  21.97 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  20.38 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  22.9 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  24.68 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.12 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  24.11 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  25.11 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  21.15 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1284  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  26.34 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 		 570 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  22.27 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  21.09 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  22.77 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  23.13 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  22.13 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  23.22 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  21.11 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29480  putative permease of ABC-2 transporter  26.7 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3886  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  22.12 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  23.7 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  23.7 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0394  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0876  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2422  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0816937 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08880  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  24.89 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.37019 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  21.33 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  22.93 
 
 		 266 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1846  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 		 274 aa  62  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.461285  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7634  ABC-2 type transporter  21.35 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26770  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  24.64 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.99915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>