222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1681 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 298 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  89.6 
 
 		 298 aa  521  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  45.19 
 
 		 313 aa  275  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0860  ABC-2 type transporter  49.15 
 
 		 324 aa  275  8e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  45.7 
 
 		 301 aa  265  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  42.81 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26770  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  39.93 
 
 		 315 aa  215  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.99915 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09070  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  37.86 
 
 		 295 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00126145  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2587  ABC-2 type transporter  37.67 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26460  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  36.49 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27980  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  37.14 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1846  ABC-2 type transporter  36.69 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.461285  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 570 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 		 283 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  27.35 
 
 		 276 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  23.63 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  27.69 
 
 		 259 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 283 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  23.05 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 604 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  27.24 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7634  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 327 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 		 278 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.67 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 269 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  27.71 
 
 		 264 aa  86.3  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 606 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  25.67 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  26.17 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  26.55 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  27.31 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2740  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  25.38 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  25.38 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  26.64 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  25.44 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 633 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  26.27 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  26.17 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  26.69 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  27.76 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  27.65 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1284  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  26.27 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3015  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  23.74 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0998219  hitchhiker  0.0000148494 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.34 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  28.5 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  25.73 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3886  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  23.44 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  24.47 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  28.04 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  26.73 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  26.43 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  23.92 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0495  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.58 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0237472  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  24.48 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08880  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.14 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.37019 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  24.67 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  24.76 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  24.76 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  25.83 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  24.76 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  22.83 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  26.81 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  25.24 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>