228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2371 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 301 aa  593  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2422  ABC-2 type transporter  39.67 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0816937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  39.46 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08880  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  39.48 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.37019 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2573  ABC-2 type transporter  38.55 
 
 		 293 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3886  ABC-2 type transporter  36.61 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  38.1 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  36.57 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0637  ABC-2 type transporter  39.44 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  37.1 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  35.53 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  39.26 
 
 		 318 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1403  ABC-2 type transporter  36.05 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.961258  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 		 633 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 278 aa  135  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  34.2 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  34.73 
 
 		 604 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  32.25 
 
 		 283 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 570 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 		 606 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  30.94 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  35.79 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  28.09 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  37.24 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  33.63 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  31.83 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  32.63 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.07 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  35.65 
 
 		 283 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 264 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  30.14 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  30.91 
 
 		 257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  27.59 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  32.77 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  27.1 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  32.7 
 
 		 264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  31.44 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  30.22 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 279 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  32 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  32.21 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  28.33 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 278 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  31.56 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  28.47 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  29 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  28.62 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0431  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  30.4 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 260 aa  99.4  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 278 aa  99  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  29.5 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  30.63 
 
 		 277 aa  99  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  31.05 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  28.62 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  29.58 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  29 
 
 		 274 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  28.63 
 
 		 264 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  29.41 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  29.78 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  28.52 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 272 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 478 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 279 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 290 aa  92.4  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  30.16 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>