274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0194 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  100 
 
 
273 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  100 
 
 
273 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  79.78 
 
 
279 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  81.25 
 
 
278 aa  455  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  80.15 
 
 
277 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  72.79 
 
 
274 aa  407  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  68.75 
 
 
283 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  67.28 
 
 
278 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  67.41 
 
 
276 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  73.26 
 
 
275 aa  367  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  59.63 
 
 
279 aa  333  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  51.84 
 
 
275 aa  297  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  53.52 
 
 
282 aa  296  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  60.22 
 
 
335 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  50.78 
 
 
282 aa  285  5.999999999999999e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  53.11 
 
 
277 aa  280  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  48.01 
 
 
279 aa  278  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  51.17 
 
 
282 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  48.25 
 
 
294 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  46.04 
 
 
278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  45.99 
 
 
277 aa  249  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  48.25 
 
 
281 aa  248  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  46.09 
 
 
295 aa  242  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  44.71 
 
 
298 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  41.6 
 
 
279 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  41.41 
 
 
269 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 
289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  38.22 
 
 
328 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  33.8 
 
 
290 aa  168  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  35.36 
 
 
283 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  35.61 
 
 
287 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  36.29 
 
 
278 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
288 aa  158  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  35.85 
 
 
276 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 
274 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 
287 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  32.57 
 
 
287 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  32.04 
 
 
292 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 
276 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  32.56 
 
 
283 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  32.56 
 
 
283 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  32.13 
 
 
253 aa  135  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 
286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  34.64 
 
 
606 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  33.93 
 
 
604 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  34.3 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 
478 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  33.92 
 
 
570 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 
263 aa  126  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 
258 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0327  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 
288 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  31.38 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  33.63 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  32.12 
 
 
633 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 
278 aa  118  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 
264 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  33.72 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  29.92 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  30.81 
 
 
257 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 
276 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  26.49 
 
 
276 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  34.11 
 
 
283 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  30.51 
 
 
268 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  28.19 
 
 
264 aa  105  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  27.6 
 
 
259 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1313  ABC-2 type transporter  29.26 
 
 
266 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368172  normal  0.0367769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  26.3 
 
 
282 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  29.15 
 
 
265 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  26.82 
 
 
298 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 
285 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 
284 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 
283 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 
294 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 
270 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  24.62 
 
 
264 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  25.84 
 
 
279 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 
310 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 
282 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 
253 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
281 aa  99.8  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 
277 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  29.15 
 
 
265 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2422  ABC-2 type transporter  32 
 
 
293 aa  99  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0816937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 
280 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  26.49 
 
 
273 aa  99  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  23.46 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 
294 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  28.24 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.22 
 
 
306 aa  97.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>