261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0626 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 275 aa  543  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  49.45 
 
 		 277 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  51.84 
 
 		 273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  51.84 
 
 		 273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  47.99 
 
 		 278 aa  298  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  47.99 
 
 		 279 aa  291  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  50.91 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  51.46 
 
 		 283 aa  287  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  50.37 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  45.62 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  44.53 
 
 		 279 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  45.65 
 
 		 335 aa  248  9e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  44.92 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  43.43 
 
 		 275 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  41.73 
 
 		 279 aa  235  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  45.56 
 
 		 277 aa  235  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  41.41 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  39.64 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  38.69 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  42.41 
 
 		 281 aa  215  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 		 278 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  41.8 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  36.22 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  35.59 
 
 		 279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  34.77 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 		 289 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  38.95 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  35.8 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  35.02 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  30.92 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  32.84 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 		 287 aa  138  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  31.67 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  29.18 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  29.18 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  27.27 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 253 aa  123  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  32.24 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 570 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  29.01 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  29.01 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  29.01 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.01 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.01 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  29.01 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  29.01 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.01 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0327  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  30.11 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  27.73 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  28.24 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 478 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  29.55 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  27.27 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 606 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  27.86 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 		 604 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  32.1 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  29.85 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  28.85 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  27.2 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  25.4 
 
 		 258 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 282 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  28.63 
 
 		 272 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 		 285 aa  98.6  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  31.23 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  27.44 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 		 281 aa  96.7  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 268 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 633 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  26.34 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 283 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  25.48 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  25.68 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>