231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2027 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 288 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  42.21 
 
 		 289 aa  235  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  41.64 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  41.18 
 
 		 283 aa  216  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  40.14 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  40.99 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  37.01 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  35 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  38.87 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  36.71 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  37.45 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0327  ABC-2 type transporter  37.46 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  34.33 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  37.61 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  31.99 
 
 		 269 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  31.99 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 273 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 273 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  34.1 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  32.31 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  35.43 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 278 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 		 277 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  31.42 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  32.06 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  32.06 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  26.82 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  30.8 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  34.25 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 335 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  34.1 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 		 263 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  28.03 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 478 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  29.77 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  29.23 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  30.97 
 
 		 570 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  26.09 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  29.45 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 604 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  28.57 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  24.51 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  28.57 
 
 		 265 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 606 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  26.25 
 
 		 237 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 278 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  27.17 
 
 		 263 aa  96.3  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  25.19 
 
 		 257 aa  95.9  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  25.66 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 278 aa  93.6  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 294 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 268 aa  92.8  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1313  ABC-2 type transporter  25.19 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368172  normal  0.0367769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  27.37 
 
 		 276 aa  89  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 257 aa  89  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0325  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 285 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.606531 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  26.72 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 		 633 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  26.79 
 
 		 268 aa  87.4  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3932  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.182483  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  25.37 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2362  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  24.41 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  23.22 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3884  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2310  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  22.39 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  24.34 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  25.28 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>