229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4049 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  61.17 
 
 		 273 aa  338  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  60.75 
 
 		 280 aa  332  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  57.71 
 
 		 279 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  59.33 
 
 		 271 aa  321  7e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  58.46 
 
 		 276 aa  318  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  57.3 
 
 		 285 aa  310  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  55.56 
 
 		 276 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  56.09 
 
 		 277 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  56.09 
 
 		 277 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  55.72 
 
 		 277 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  56.09 
 
 		 277 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  56.09 
 
 		 277 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  56.09 
 
 		 277 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  56.09 
 
 		 277 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  56.09 
 
 		 277 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  56.23 
 
 		 298 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  56.23 
 
 		 275 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  58.49 
 
 		 275 aa  298  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  53.73 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  57.89 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  50.92 
 
 		 273 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  57.35 
 
 		 272 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  50.75 
 
 		 283 aa  256  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  44.83 
 
 		 271 aa  255  6e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  50.38 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  49.08 
 
 		 275 aa  249  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  49.22 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29480  putative permease of ABC-2 transporter  46.74 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0884  ABC-2 type transporter  41.98 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0027  hypothetical protein  46.03 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  41.2 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  42.38 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  36.68 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3946  ABC-2 type transporter  37.84 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  34.35 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  33.09 
 
 		 272 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  34.21 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  31.84 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  35.14 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  33.62 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  36.8 
 
 		 277 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  37.95 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  31.06 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 272 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  35.14 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  31.78 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  32.17 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  30.13 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 		 279 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  33.08 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  30.51 
 
 		 633 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  29.6 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  30.87 
 
 		 310 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  26.36 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 570 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  26.61 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  27.06 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.56 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  29.29 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 		 282 aa  99  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 		 606 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  31.32 
 
 		 277 aa  95.5  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2182  ABC polysaccharide/polyol phosphate export systems, inner membrane subunit  32.3 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.718271  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 604 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  28.22 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 478 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 283 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  24.63 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 278 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>