191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0027 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007641  Rru_B0027  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  47.72 
 
 		 277 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  47.72 
 
 		 277 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  47.72 
 
 		 277 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  47.72 
 
 		 277 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  47.72 
 
 		 277 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  47.72 
 
 		 277 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  47.72 
 
 		 277 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  47.48 
 
 		 271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  47.28 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  47.92 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  46.03 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  46.69 
 
 		 272 aa  211  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  44.35 
 
 		 276 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  47.7 
 
 		 275 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  45.61 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  47.28 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  46.03 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  45.8 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  43.51 
 
 		 298 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  45.19 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  46.86 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  40.34 
 
 		 257 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  42.02 
 
 		 275 aa  178  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  43.1 
 
 		 282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  37.66 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  40.83 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  41.49 
 
 		 283 aa  168  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  41.49 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29480  putative permease of ABC-2 transporter  41.08 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  38.53 
 
 		 280 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  34.6 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0884  ABC-2 type transporter  37.24 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 284 aa  125  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  31.38 
 
 		 294 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  32.5 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3946  ABC-2 type transporter  33.75 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  28.33 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  31.73 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  25.52 
 
 		 264 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  28.33 
 
 		 278 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 272 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 268 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  31.28 
 
 		 265 aa  92  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 265 aa  92  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  30.58 
 
 		 265 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 		 570 aa  89  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 282 aa  89  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  33.06 
 
 		 277 aa  88.6  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 278 aa  88.2  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 604 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 606 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 261 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  27.2 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  27.8 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  25.81 
 
 		 264 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 633 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  26.97 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  25.31 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  23.95 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  26.14 
 
 		 276 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  24.69 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 288 aa  72  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 283 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>