241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2516 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  100 
 
 
273 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  48.85 
 
 
298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  49.05 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  46.69 
 
 
285 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  47.86 
 
 
276 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  50 
 
 
272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  46.36 
 
 
273 aa  232  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  45.13 
 
 
277 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  45.26 
 
 
279 aa  231  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  45.25 
 
 
277 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  45.25 
 
 
277 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  45.25 
 
 
277 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  45.25 
 
 
277 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  45.25 
 
 
277 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  45.25 
 
 
277 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  45.25 
 
 
277 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  47.37 
 
 
271 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  42.97 
 
 
280 aa  224  9e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  43.61 
 
 
275 aa  221  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  43.68 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  43.13 
 
 
273 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  44.11 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  43.54 
 
 
275 aa  214  9e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  45.42 
 
 
257 aa  214  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  43.89 
 
 
276 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  42.59 
 
 
283 aa  205  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  43.33 
 
 
283 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  43.73 
 
 
282 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  37.96 
 
 
271 aa  193  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29480  putative permease of ABC-2 transporter  39.69 
 
 
267 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  39.21 
 
 
280 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  37.97 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  39.38 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0884  ABC-2 type transporter  41 
 
 
262 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  35 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3946  ABC-2 type transporter  36.4 
 
 
274 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346404  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0027  hypothetical protein  38.59 
 
 
239 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 
263 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 
284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  33.08 
 
 
264 aa  136  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  32.06 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
261 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 
268 aa  123  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  35.09 
 
 
277 aa  123  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  32.32 
 
 
280 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  33.62 
 
 
265 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  34.06 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 
263 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  31.78 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 
278 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 
270 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  30.57 
 
 
276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  31.2 
 
 
264 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  34.68 
 
 
310 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  31.98 
 
 
268 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 
268 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 
258 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  33.71 
 
 
277 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  28.98 
 
 
570 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 
282 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 
295 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 
266 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 
260 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 
289 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 
478 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 
281 aa  102  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 
279 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  30.04 
 
 
275 aa  102  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 
261 aa  102  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2182  ABC polysaccharide/polyol phosphate export systems, inner membrane subunit  30.89 
 
 
259 aa  102  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.718271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 
294 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 
269 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 
282 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  29.31 
 
 
604 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 
279 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 
278 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  28 
 
 
257 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 
301 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  29.28 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  27.13 
 
 
259 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 
633 aa  99  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 
606 aa  98.6  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 
294 aa  95.9  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  27 
 
 
282 aa  95.9  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  29.83 
 
 
287 aa  95.5  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  26.52 
 
 
283 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>