211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1363 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  100 
 
 
284 aa  557  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  53.26 
 
 
277 aa  248  6e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  37.31 
 
 
276 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  37.26 
 
 
276 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  36.68 
 
 
272 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  32.82 
 
 
277 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  32.82 
 
 
277 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  32.82 
 
 
277 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 
277 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 
277 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 
277 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 
277 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 
277 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  34.3 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  34.75 
 
 
257 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  33.98 
 
 
298 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  35.23 
 
 
275 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  33.81 
 
 
294 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  32.7 
 
 
273 aa  148  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 
283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  35.07 
 
 
283 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 
271 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  34.36 
 
 
276 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 
285 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  31.66 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  31.18 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 
273 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  34.7 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  34.24 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  32.32 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  32.05 
 
 
264 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 
570 aa  128  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  33.58 
 
 
272 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  34.48 
 
 
272 aa  125  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  31.47 
 
 
265 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  27.21 
 
 
276 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 
257 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 
263 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 
258 aa  123  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  34.25 
 
 
265 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  31.84 
 
 
237 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 
260 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  27.99 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  29.54 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  31.13 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 
633 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  31.41 
 
 
310 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 
294 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29480  putative permease of ABC-2 transporter  33.59 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  32.02 
 
 
264 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 
265 aa  112  9e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  28.74 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 
282 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 
274 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 
253 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 
282 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2182  ABC polysaccharide/polyol phosphate export systems, inner membrane subunit  31.6 
 
 
259 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.718271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 
279 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 
298 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
606 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0027  hypothetical protein  32.08 
 
 
239 aa  105  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  26.36 
 
 
276 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 
290 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 
264 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 
604 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  31.32 
 
 
267 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 
294 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 
280 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  29.96 
 
 
318 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0884  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 
262 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
278 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  28.52 
 
 
263 aa  102  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.78 
 
 
255 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 
267 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 
268 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 
295 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 
283 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  31.44 
 
 
287 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3946  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 
274 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346404  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 
278 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 
273 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 
273 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 
266 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 
316 aa  99.4  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  26.34 
 
 
276 aa  99.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 
276 aa  99  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
478 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>