235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3346 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  521  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  85.07 
 
 
268 aa  432  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  67.99 
 
 
278 aa  367  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  67.99 
 
 
278 aa  367  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  67.97 
 
 
272 aa  358  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  35.27 
 
 
263 aa  139  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 
258 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  33.08 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  34.22 
 
 
277 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  33.46 
 
 
277 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  33.46 
 
 
277 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  31.46 
 
 
276 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
277 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
277 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
277 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
277 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
277 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
478 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 
273 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 
283 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 
283 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  33.09 
 
 
282 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  29.53 
 
 
257 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  29.66 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  31.64 
 
 
275 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 
268 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  29.92 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  29.84 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  28.4 
 
 
273 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 
267 aa  108  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  30.68 
 
 
280 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  30.31 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  28.63 
 
 
275 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  28.24 
 
 
271 aa  106  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
265 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 
271 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  30.22 
 
 
278 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 
283 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 
294 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  27.48 
 
 
276 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 
298 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 
284 aa  102  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 
280 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  31.7 
 
 
310 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 
285 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
570 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  30.27 
 
 
283 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 
282 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 
284 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  26.79 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29480  putative permease of ABC-2 transporter  27.78 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  30.51 
 
 
281 aa  96.7  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  28.29 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  29.56 
 
 
259 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 
295 aa  95.9  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 
294 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  30.9 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  27.82 
 
 
264 aa  94.7  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0431  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 
253 aa  94  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  23.99 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  28.62 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  26.28 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.53 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  28.86 
 
 
276 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  31.65 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 
283 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 
277 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 
261 aa  88.6  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3886  ABC-2 type transporter  32.65 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  29.78 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  24.41 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  31.65 
 
 
318 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  26.05 
 
 
276 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 
258 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  27.39 
 
 
287 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  29.91 
 
 
265 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  29.73 
 
 
275 aa  86.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2573  ABC-2 type transporter  33.17 
 
 
293 aa  86.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  28.97 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1284  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2182  ABC polysaccharide/polyol phosphate export systems, inner membrane subunit  29.28 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.718271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 
288 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>