216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3886 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3886  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 296 aa  586  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2422  ABC-2 type transporter  59.47 
 
 		 293 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0816937 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08880  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  59.66 
 
 		 287 aa  318  7.999999999999999e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.37019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  59.14 
 
 		 293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2573  ABC-2 type transporter  59.25 
 
 		 293 aa  310  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  53.29 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0637  ABC-2 type transporter  47.62 
 
 		 287 aa  208  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1403  ABC-2 type transporter  40.97 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.961258  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  36.61 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  32.29 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  32.62 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  34.74 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  29.25 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  33.09 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 606 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 604 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 570 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 478 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  26.47 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 258 aa  99.8  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  27.3 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0431  ABC-2 type transporter  32.86 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  25.67 
 
 		 278 aa  96.3  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  30.87 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  28.52 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  29.45 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 		 253 aa  93.2  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 294 aa  92.4  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  28.17 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  27.84 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 		 633 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 273 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  29.26 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 275 aa  89.7  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 258 aa  89.7  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 274 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 277 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 268 aa  87  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 265 aa  85.9  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  29.15 
 
 		 272 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  27.63 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  29.27 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  28.7 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  29.26 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  30.97 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  25.88 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  28.38 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  29.31 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  26.69 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  26.55 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  25.82 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  23.29 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  24.82 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  26.91 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  27.04 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26770  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  24.89 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.99915 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  28.41 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  25.7 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  27.48 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  25.37 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  27.46 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>