219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2422 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2422  ABC-2 type transporter  100 
 
 
293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0816937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  88.74 
 
 
293 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2573  ABC-2 type transporter  57 
 
 
293 aa  315  4e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3886  ABC-2 type transporter  58.67 
 
 
296 aa  311  5.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08880  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  57 
 
 
287 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.37019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  54.79 
 
 
306 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1403  ABC-2 type transporter  42.12 
 
 
300 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.961258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0637  ABC-2 type transporter  44.86 
 
 
287 aa  193  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  39.67 
 
 
301 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 
310 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  33.1 
 
 
276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  32.29 
 
 
316 aa  125  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 
257 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  33.09 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  32.01 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 
281 aa  105  6e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  27.9 
 
 
259 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 
294 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  32.25 
 
 
279 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 
478 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 
278 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 
273 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 
278 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 
273 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 
258 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 
274 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 
282 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 
294 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 
279 aa  99.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 
276 aa  99  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  31 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 
269 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  30.29 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 
278 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 
278 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 
258 aa  95.5  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 
606 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 
604 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  30.87 
 
 
274 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  29.96 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0431  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  32.41 
 
 
257 aa  92  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  29 
 
 
270 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  32.73 
 
 
282 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  29.34 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 
268 aa  89.7  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 
265 aa  89.4  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 
287 aa  89.4  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  26.89 
 
 
264 aa  89  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 
285 aa  89  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  30.8 
 
 
276 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 
279 aa  89  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 
283 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  33.01 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  29.85 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.46 
 
 
278 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  26.74 
 
 
268 aa  87.4  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 
260 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 
277 aa  86.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 
570 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 
263 aa  85.9  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
633 aa  85.9  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 
268 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 
284 aa  85.5  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 
283 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 
281 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  30.53 
 
 
265 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  29.82 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  29.43 
 
 
253 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  32.32 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  28.77 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  29.65 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  29.82 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0610  hypothetical protein  26.32 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  32.04 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  27.1 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  29.63 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  24.46 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  27 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  28.91 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>