252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2045 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  100 
 
 
266 aa  531  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  54.15 
 
 
284 aa  263  2e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  50.4 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  40.4 
 
 
478 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  37.35 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  35.36 
 
 
258 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  33.61 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  34.96 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  32.78 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  34.94 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  34.72 
 
 
604 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  34.98 
 
 
285 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  34.14 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 
606 aa  125  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  32.35 
 
 
283 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  33.33 
 
 
268 aa  123  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  32.44 
 
 
264 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 
281 aa  122  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
310 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  36.15 
 
 
633 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  32.77 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  36.67 
 
 
278 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  31.44 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 
570 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  35.32 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  34.86 
 
 
265 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  32.03 
 
 
282 aa  111  9e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  34.23 
 
 
269 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 
263 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 
283 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  28.33 
 
 
276 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 
282 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  29.03 
 
 
272 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  29.73 
 
 
279 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  30.33 
 
 
276 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 
316 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  27.16 
 
 
258 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  31.29 
 
 
318 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 
279 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 
271 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 
265 aa  105  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  26.75 
 
 
259 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 
276 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 
278 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 
278 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  27.91 
 
 
271 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 
283 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  27.63 
 
 
272 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 
268 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 
272 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  26.53 
 
 
264 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  29.12 
 
 
301 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 
268 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 
289 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 
277 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  31.18 
 
 
237 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 
273 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 
273 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0610  hypothetical protein  27.08 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  25.79 
 
 
298 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  28.74 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  29.63 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  29.63 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
281 aa  95.9  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  29.73 
 
 
268 aa  95.5  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  25.95 
 
 
273 aa  95.5  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  27.63 
 
 
264 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  26.85 
 
 
313 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  28.89 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  27.08 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  28.23 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  30.88 
 
 
257 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 
268 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 
275 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 
290 aa  92.8  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
276 aa  92.4  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  32.02 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 
293 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 
278 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  29.96 
 
 
287 aa  90.1  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0524  hypothetical protein  23.26 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>