197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8935 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  100 
 
 		 313 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  68.05 
 
 		 301 aa  411  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0860  ABC-2 type transporter  52.12 
 
 		 324 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  45.19 
 
 		 298 aa  275  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  45.22 
 
 		 298 aa  268  7e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26770  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  38.71 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.99915 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.88 
 
 		 296 aa  202  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26460  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  36.58 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09070  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  40.65 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00126145  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2587  ABC-2 type transporter  35.78 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27980  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.25 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1846  ABC-2 type transporter  36.79 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.461285  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 570 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  27.55 
 
 		 478 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7634  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 606 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  25.44 
 
 		 604 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 257 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 633 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 278 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 258 aa  90.1  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 279 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  23.88 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  27.07 
 
 		 259 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  26.69 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  31.79 
 
 		 237 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  25.48 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.84 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  23.73 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  24.26 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  28.62 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  25.42 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  27.09 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  28.2 
 
 		 277 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1284  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  25.94 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0431  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  24.34 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  24.43 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  24.43 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  22.47 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  24.18 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  23.24 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  21.82 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  22.85 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3015  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  29.05 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0998219  hitchhiker  0.0000148494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  25 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  22.98 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  22.1 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  23.73 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  27.4 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  21.8 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  24.69 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14690  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  22.08 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.544705  hitchhiker  0.00000217507 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  21.69 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  21.69 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  22.9 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  21.69 
 
 		 268 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>