233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1748 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 316 aa  626  1e-178  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  38.8 
 
 		 310 aa  185  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  42.65 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  39.66 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  34.02 
 
 		 633 aa  155  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  33.92 
 
 		 257 aa  152  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  32.32 
 
 		 604 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  32.4 
 
 		 570 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  37.12 
 
 		 283 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  36.02 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  32.4 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  31.49 
 
 		 606 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  30.22 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  36.24 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  35.68 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08880  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.31 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.37019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2422  ABC-2 type transporter  32.76 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0816937 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.17 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  34.83 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  34.77 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  29.62 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  30.39 
 
 		 263 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3886  ABC-2 type transporter  34.74 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2573  ABC-2 type transporter  32.51 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  27.3 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  30.3 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  34.84 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  31.6 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 261 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 290 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  28.27 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  27.7 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  30.87 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  29.78 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  28.62 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  31.33 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  29.57 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 278 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 284 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  30.8 
 
 		 237 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  30.13 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  33.04 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  31 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1403  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.961258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0610  hypothetical protein  32.07 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 478 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  28.62 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  29.2 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  31.58 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  27.73 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 276 aa  99  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  34.07 
 
 		 272 aa  99  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  30.58 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  32.08 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  29.9 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  31.65 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0637  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 287 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 287 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  33.33 
 
 		 276 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  29.63 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  32.55 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0431  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 275 aa  92.4  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2182  ABC polysaccharide/polyol phosphate export systems, inner membrane subunit  31.5 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.718271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  27.83 
 
 		 269 aa  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  34.05 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  29.55 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  26.3 
 
 		 275 aa  89.4  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 266 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 275 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>