192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0637 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0637  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 287 aa  560  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2573  ABC-2 type transporter  46.5 
 
 		 293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3886  ABC-2 type transporter  47.62 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08880  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  45.52 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.37019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  46.23 
 
 		 293 aa  226  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2422  ABC-2 type transporter  44.86 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0816937 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  42.51 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  40.67 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1403  ABC-2 type transporter  41.7 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.961258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  32.47 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  35.53 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  31.32 
 
 		 278 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  31.93 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  33.18 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  32 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  31.63 
 
 		 478 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  31.74 
 
 		 633 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  31.43 
 
 		 272 aa  99  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  32.1 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  32.65 
 
 		 604 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  35.75 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 		 273 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  30.32 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 570 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  32.72 
 
 		 268 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 		 606 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0431  ABC-2 type transporter  32.84 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  31.73 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  27.4 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  24.71 
 
 		 259 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 		 278 aa  89  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 272 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 280 aa  89  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  29.62 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  26.55 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 258 aa  86.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  29.95 
 
 		 272 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  31.14 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  31.14 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  29.03 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  30.45 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  28.52 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  30.96 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  29.38 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  27.1 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  24.16 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  27.65 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  26.53 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  27.82 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  29.78 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  30.09 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  28.35 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  28.76 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  29.44 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>