242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2268 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  100 
 
 		 259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  36.22 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  31.97 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  32.55 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 570 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 283 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  30.8 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  30.67 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  31.23 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  33.97 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  31.62 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  34.45 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  29.06 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  30.81 
 
 		 282 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  32.21 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 282 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  33.49 
 
 		 606 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  28.27 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 604 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  32.28 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  26.1 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  26.77 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 633 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 278 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  26.67 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3015  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  31.58 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0998219  hitchhiker  0.0000148494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  26.61 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 478 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08880  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.85 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.37019 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  25.1 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  29.41 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2573  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 293 aa  99  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  27.06 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  27.13 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0610  hypothetical protein  27.08 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  28.63 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 301 aa  96.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  26.86 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 294 aa  96.3  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 268 aa  96.3  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  25.1 
 
 		 273 aa  95.5  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1284  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  29.05 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  24.3 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2422  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0816937 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  26.61 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  26.61 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.17 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 298 aa  92.4  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  32.21 
 
 		 269 aa  92.4  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3886  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 296 aa  92.4  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  23.51 
 
 		 277 aa  92  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  23.51 
 
 		 277 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.13 
 
 		 306 aa  92  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  23.51 
 
 		 277 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  23.51 
 
 		 277 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>