236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0190 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 253 aa  495  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  42.63 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  39.13 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 		 570 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 		 478 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  31.87 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  33.09 
 
 		 604 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  32.67 
 
 		 265 aa  139  6e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  34.31 
 
 		 606 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  30.89 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  31.52 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  31.99 
 
 		 633 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  34.69 
 
 		 266 aa  125  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  31.01 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  33.59 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  32.94 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  35.04 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 		 283 aa  121  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 277 aa  119  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  31.33 
 
 		 275 aa  119  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  33.9 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 316 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  29.72 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  31.08 
 
 		 282 aa  115  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  30.89 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  27.76 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0610  hypothetical protein  29.92 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  30.83 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  30.83 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  28.36 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  30.83 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  30.83 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  30.83 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  30.83 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  30.83 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  30.83 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.67 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  28.02 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 277 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  31.89 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 278 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 294 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  26.95 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  29.76 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  29.57 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 294 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  28.46 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1284  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  28.29 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 271 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  29.96 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  32.33 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  30.5 
 
 		 276 aa  101  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  31.78 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  31.2 
 
 		 277 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  27.1 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  27.93 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  26 
 
 		 283 aa  98.6  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  26 
 
 		 283 aa  98.6  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2573  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 293 aa  97.8  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 278 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  28.68 
 
 		 272 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 272 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>