226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5679 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  49.82 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0431  ABC-2 type transporter  50.18 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  43.07 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  41.88 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  28.29 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  29.83 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08880  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.77 
 
 		 287 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.37019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  25.8 
 
 		 570 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  29.15 
 
 		 237 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  28.01 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 633 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 604 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 606 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  28.09 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  31.23 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  25.55 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  25.55 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  25.55 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 278 aa  99  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2573  ABC-2 type transporter  26.43 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  24.64 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 273 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 273 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 273 aa  95.9  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 		 261 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 310 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  26.28 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  27.41 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  25.93 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  31.44 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 263 aa  93.6  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  30.27 
 
 		 279 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 298 aa  92.8  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  28 
 
 		 268 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  31.6 
 
 		 268 aa  92.8  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  25.1 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  25.1 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  25.1 
 
 		 268 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  25.62 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 281 aa  89.7  6e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 		 328 aa  89  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  25.19 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2422  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0816937 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  25.7 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  27.43 
 
 		 277 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  28.14 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27980  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.2 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  24.35 
 
 		 271 aa  85.5  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  25.75 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0860  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.88 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  25.1 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3886  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  27.75 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  24.03 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  26.44 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26770  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.24 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.99915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  28.36 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  25.75 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>